實(shí)驗(yàn)原理
將ChIP與第二代測(cè)序技術(shù)相結(jié)合的ChIP-Seq技術(shù)，能夠高效地在全基因組范圍內(nèi)檢測(cè)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA區(qū)段。ChIP-Seq的原理是：首先通過(guò)染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)（ChIP）特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA片段，并對(duì)其進(jìn)行純化與文庫(kù)構(gòu)建；然后對(duì)富集得到的DNA片段進(jìn)行高通量測(cè)序。研究人員通過(guò)將獲得的數(shù)百萬(wàn)條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA區(qū)段信息。
實(shí)驗(yàn)流程
（1）甲醛交聯(lián)整個(gè)細(xì)胞系（組織），將目標(biāo)蛋白與染色質(zhì)連結(jié)起來(lái)；
（2）分離基因組DNA，并用超聲波將其打斷成一定長(zhǎng)度的小片段；
（3）添加與目標(biāo)蛋白質(zhì)特異的抗體，該抗體與目標(biāo)蛋白形成免疫沉淀免疫結(jié)合復(fù)合體；
（4）去交聯(lián)，純化DNA即得到染色質(zhì)免疫沉淀的DNA樣本；
（5）將準(zhǔn)備好的樣本進(jìn)行深度測(cè)序。
結(jié)果展示
